承担国家自然基金、中石油创新基金、重庆市科技局—市教委联合基金（重点）、重庆市自然科学基金等省部级科研项目10余项，发表SCI、EI和中文核心论文30余篇，授权发明专利2项。承担《结构化学》、《普通化学》等本科课程；承担省部级教研教改项目3项，获重庆市化学化工学会教学成果三等奖1项；指导研究生21名，指导大学生获中国国际大学生创新大赛国赛铜奖2项、省级金奖3项，省级挑战杯一等奖1项。
代表性学术成果：
1.项目:《新型环境友好型松材线虫防治药物的研究》, 重庆市市级科技兴林科学研究类项目, 2024-2026.
2.项目:《数据与知识嵌合的口服固体制剂高保真工业大模型的构建》, 重庆市科学技术局-重庆市教委联合基金（重点）项目, 2023-2026.
3.项目:《土壤污染防治管理技术支撑包4土壤污染防治技术指南编制》，重庆市生态环境局，2024-2025.
4.项目:《湖泊型集中式饮用水源地营养元素原位生态修复技术》, 重庆市科委技术创新与应用示范专项（重点研发项目）子课题, 2019-2021.
5.项目:《断面尺度入河污染源类型精准识别与致污知识图谱研究》, 重庆市科委技术创新与应用示范项目（重点示范项目）子课题, 2018-2019.
6.论文:Shuangkou Chen*, Xin Yang, Xia Huang, Qiuyue Chen, Yu Wang，Wanhong Zhu, Junjie Chen.Discovery of environmentally friendly pine wood nematode inhibitors from natural product insecticide databases based on homology modeling and molecular docking,Journal of Molecular Structure,2026,1349:143594.
7.论文:黄夏, 陈双扣*, 杨鑫, 松材线虫琥珀酸脱氢酶潜在抑制剂的虚拟筛选及活性评价[J].农药学学报,2026,28(2):256-268.
8.论文:杨鑫, 陈双扣*, 黄夏, 等. 基于同源建模和虚拟筛选松材线虫海藻糖磷酸酶抑制剂的发现研究[J].西部林业科学, 2025, 54(1): 73-84.
9.论文:Wanhong Zhu; Shuangkou Chen*; Yu Wang; Xi Xu; Xia Huang; Xin Yang; Fengming Ren ;Investigation into the Quantitative Structure-Biotoxicity Relationship of Antibiotics and their Estrogenic Receptor Disruption Effects, Chemistry & Biodiversity, 2024, e202401843: 1-16
10.论文:王瑜,陈双扣*,朱万宏等. 二噁英及其类似物的雄激素干扰效应的虚拟筛选和分子动力学模拟 [J]. 环境科学学报, 2024, 44(3):468-478.
11.论文:徐明鑫,陈双扣*,谭小庆等. 基于分子对接的DNA拓扑异构酶Ⅳ抑制剂的虚拟筛选研究 [J]. 中国药学杂志, 2023, 58 (10): 875-883.
12.论文:陈双扣,唐思,谭小庆等. 基于分子对接虚拟筛选铜绿假单胞菌胞外酶exoS抑制剂的研究 [J]. 化学研究与应用, 2023, 35 (07): 1624-1634.
13.论文:Xiaoqing Tan, Shuangkou Chen*, Si Tang, et al. The anti-inflammatory mechanism of tauroursodeoxycholic acid based on network pharmacology and molecular docking[J]. Letters in Drug Design & Discovery, 2023, 20(9): 1360-1371.
14.论文:Si Tang, Shuangkou Chen, Xiaoqing Tan, et al. Network pharmacology prediction and molecular docking-based strategy to explore the pharmacodynamic substances and mechanism of "Mung Bean" against bacterial infection[J]. Drug Development and Industrial Pharmacy, 2022, 48(2): 58-68.
15.论文:Shuangkou Chen, Xiaoqing Tan, Si Tang, et al. Discovery of novel 5′-methylthioadenosine nucleosidase inhibitors by virtual screening and bioassays[J]. Journal of Molecular Structure, 2022, 1270: 133948-133958.
